Daugeliui vartotojų USB atmintinės yra ideali priemonė: USB atmintinės yra mažos, nebrangios ir siūlo daug vietos. Nenuostabu, kad vis mažiau įrašoma CD ir DVD. Tačiau kai reikia formatuoti USB atmintinę, reikia atsižvelgti į keletą dalykų
Paprastai USB atmintines reikia formatuoti naudojant FAT32 failų sistemą: Šią failų sistemą atpažįsta ne tik „Windows 7“, „Windows Vista“ ir „Windows XP“, bet ir kompiuteriai su „Mac OS X“ ir „Linux“.
Tačiau su FAT32 galima pastebėti, kad failas negali būti didesnis nei 4 gigabaitai. Nors šią kliūtį yra gana sunku peršokti ir ją lengva apeiti, kitas trūkumas yra kur kas didesnis: USB atmintinės gali turėti maksimalią 32 gigabaitų atminties talpą, jei jos bus suformatuotos naudojant FAT32. USB atmintinės, kurių talpa didesnė nei 32 gigabaitai, šiuo metu vis dar yra palyginti brangios, tačiau kainos vis mažėja, todėl turėtumėte nepamiršti šios dydžio ribos.
„ExFAT“ neriboja failų dydžio ar bendros USB atmintinės talpos: „Microsoft“ šią failų sistemą pristatė naudodama „Windows 7“, todėl „ExFAT“ standartiškai palaiko tik „Windows 7“. Kita vertus, sistemoje „Windows Vista“ jums reikia 1 pakeitimų paketo, su kuriuo atnaujinamas „ExFAT“ palaikymas. „Microsoft“ išleido atskirą „Windows XP“ naujinimą, kad USB atmintinės su „ExFAT“ galėtų būti naudojamos kaip failų sistema: http://support.microsoft.com/kb/955704
Kita vertus, mes visiškai nerekomenduojame FAT: ši failų sistema dabar yra pasenusi, todėl nebereikėtų jos naudoti. NTFS taip pat turi nemažai trūkumų, nes sistemos su „Mac OS X“ kaip operacinė sistema paprastai gali nuskaityti tokias USB atmintines, bet negali joms įrašyti failų.
